{"id":84084,"date":"2023-10-26T20:04:11","date_gmt":"2023-10-27T02:04:11","guid":{"rendered":"https:\/\/www.aliados17.com\/?p=84084"},"modified":"2023-10-26T20:04:11","modified_gmt":"2023-10-27T02:04:11","slug":"la-patologia-digital-y-el-aprendizaje-profundo-bases-de-proyecto-para-identificar-cancer-de-mama","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.aliadospuebla.com\/?p=84084","title":{"rendered":"La patolog\u00eda digital y el aprendizaje profundo, bases de proyecto para identificar c\u00e1ncer de mama"},"content":{"rendered":"<p><b><span lang=\"ES-TRAD\">Santa Mar\u00eda Tonantzintla, Puebla, a<\/span><\/b><b><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a026<\/span><\/b><b><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0de octubre de 2023.-<\/span><\/b><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">Optimizar los m\u00e9todos de diagn\u00f3stico del c\u00e1ncer de mama a partir del an\u00e1lisis del microambiente tumoral mediante el an\u00e1lisis automatizados de im\u00e1genes digitales, es uno de los objetivos de un proyecto que se desarrolla en el Instituto Nacional de Astrof\u00edsica, \u00d3ptica y Electr\u00f3nica (INAOE), centro de investigaci\u00f3n del Consejo Nacional de Humanidades, Ciencias y Tecnolog\u00edas (Conahcyt).<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">Se trata de un proyecto interdisciplinario en el cual trabajan investigadores y estudiantes de Ciencias Computacionales y Ciencias y Tecnolog\u00edas Biom\u00e9dicas del INAOE, y m\u00e9dicos y especialistas del Instituto Jalisciense de Cancerolog\u00eda y del Centro de Ense\u00f1anza T\u00e9cnica Industrial (CETI), de Jalisco.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">El proyecto surgi\u00f3 a partir de la colaboraci\u00f3n con investigadores de Jalisco<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">, el doctor Jos\u00e9 Cruz Ramos y la doctora<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0Gabriela L\u00f3pez Armas<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">.\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">Hace dos a\u00f1os se desarroll\u00f3 una primer tesis de maestr\u00eda en Ciencias y Tecnolog\u00edas Biom\u00e9dicas del INAOE. Actualmente H\u00e9ctor Zepeda Reyes y Miguel Loria Romero, estudiantes<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0de doctorado del INAOE, trabajan en el tema.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">La doctora Hayde Peregrina Barreto, investigadora del INAOE y l\u00edder del proyecto, informa que se est\u00e1 trabajando con bases de datos p\u00fablicas<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0de<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">muestras digitales de cortes histopatol\u00f3gicos de c\u00e1ncer en las cuales hay sospecha de c\u00e1ncer.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">\u201cDe la biopsia se hacen cortes para analizar peque\u00f1os fragmentos del tejido y ver qu\u00e9 tan presente est\u00e1 la malignidad o confirmarla. En ese tejido se estudian las estructuras de las c\u00e9lulas y otras estructuras espec\u00edficas del c\u00e1ncer de mama como los\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">t\u00fabulos<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">,\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">las<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0c\u00e9lulas que ya est\u00e1n haciendo mitosis y los n\u00facleos\u201d, comenta.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">El proyecto busca automatizar dicho an\u00e1lisis y cuantificar la variaci\u00f3n de las estructuras, procedimiento que el pat\u00f3logo tradicionalmente hace observando el microscopio y con base en la experiencia.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">\u201cMuchos estudios han concluido que puede haber\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">una discrepancia significativa entre pat\u00f3logos. Para tener una referencia m\u00e1s precisa de qu\u00e9 es lo que se est\u00e1 evaluando, se han comenzado a desarrollar metodolog\u00edas<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0digitales de an\u00e1lisis de im\u00e1genes digitales para apoyar en este proceso en el cual el pat\u00f3logo observa una cierta cantidad de campos o de espacios sobre la muestra y sobre cada una de ellas hace conteos, determinaci\u00f3n de forma, an\u00e1lisis de esas estructuras. Es una tarea que requiere mucho tiempo. Si podemos automatizar al menos una parte de la tarea, ayudar\u00edamos al pat\u00f3logo evitando la fatiga y reduciendo los tiempos y costos\u201d.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">H\u00e9ctor Zepeda Reyes, estudiante de doctorado de Ciencias y Tecnolog\u00edas Biom\u00e9dicas del INAOE, se ha involucrado en el proyecto gracias a su formaci\u00f3n como bi\u00f3logo molecular. \u201cSiempre me llam\u00f3 la atenci\u00f3n trabajar sobre c\u00e1ncer de mama. Como ya ten\u00eda cierto trabajo durante la maestr\u00eda con procesamiento de im\u00e1genes, le propuse a la doctora Hayde una idea que ya ten\u00eda,\u00a0\u00a0y la doctora ya ten\u00eda el antecedente de la compa\u00f1era de la maestr\u00eda. Mi proyecto est\u00e1 enfocado sobre todo en el an\u00e1lisis\u00a0\u00a0del estroma. El estroma se comporta como el entorno celular. Si bien a la hora de realizar el diagn\u00f3stico el pat\u00f3logo se enfoca en estructuras como las c\u00e9lulas, la mitosis y las l\u00faminas, hay un nuevo enfoque que trata de evaluar c\u00f3mo se comporta el entorno celular y cu\u00e1les son sus patrones estructurales, porque est\u00e1 muy relacionado con el desarrollo y la malignidad del c\u00e1ncer. Evaluar esto con las\u00a0\u00a0herramientas de procesamiento de im\u00e1genes\u00a0\u00a0y de inteligencia artificial nos ayudar\u00e1 a tener una mejor precisi\u00f3n a la hora del diagn\u00f3stico y ofrecer mejores herramientas a los especialistas\u201d, expresa.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">En 2024, H\u00e9ctor Zepeda realizar\u00e1 una estancia en el Instituto Jalisciense de Cancerolog\u00eda para comenzar a etiquetar todas las muestras\u00a0\u00a0y trabajar, en conjunto con el pat\u00f3logo, en una base de datos de mujeres mexicanas.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">La doctora Hayde Peregrina notifica que con otro de sus estudiantes de doctorado, Miguel Loria Romero, y en colaboraci\u00f3n con un investigador de la Universidad de Alcal\u00e1, Espa\u00f1a, est\u00e1n trabajando en el desarrollo de una herramienta enfocada a la educaci\u00f3n o entrenamiento especializado de los pat\u00f3logos. Apunta asimismo que este tipo de proyectos depende de una fuerte colaboraci\u00f3n con sus pares m\u00e9dicos.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">\u201cDado que puede\u00a0<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">haber discrepancia entre los pat\u00f3logos, queremos hacer un sistema que eval\u00fae lo que observan y luego a trav\u00e9s de un modelo de\u00a0<\/span><i><span lang=\"ES-TRAD\">deep learning<\/span><\/i><span lang=\"ES-TRAD\">\u00a0o aprendizaje profundo podemos indicarle si fall\u00f3 o si le falt\u00f3 alg\u00fan elemento, lo que permitir\u00e1 tener una m\u00e9trica de c\u00f3mo va mejorando su entrenamiento. El aprendizaje profundo permite reunir informaci\u00f3n, que ya tiene una etiqueta y alimentar un modelo que puede aprender con la ayuda de la informaci\u00f3n que da el pat\u00f3logo y eso nos permite refinar los resultados, pudiendo ser m\u00e1s confiables<\/span><span lang=\"ES-TRAD\">\u201d, subraya.<\/span><\/p>\n<p><span lang=\"ES-TRAD\">Para finalizar, H\u00e9ctor Zepeda indica que ya tienen resultados interesantes y que se ampl\u00eda el abanico de ideas y an\u00e1lisis: \u201cDesde el enfoque biol\u00f3gico, esta combinaci\u00f3n entre la parte computacional y la biol\u00f3gica definir\u00e1 el futuro del \u00e1rea biom\u00e9dica\u201d.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Santa Mar\u00eda Tonantzintla, Puebla, a\u00a026\u00a0de octubre de 2023.-\u00a0Optimizar los m\u00e9todos de diagn\u00f3stico del c\u00e1ncer de mama a partir del an\u00e1lisis del microambiente tumoral mediante el an\u00e1lisis automatizados de im\u00e1genes digitales, es uno de los objetivos de un proyecto que se desarrolla en el Instituto Nacional de Astrof\u00edsica, \u00d3ptica y Electr\u00f3nica (INAOE), centro de investigaci\u00f3n del Consejo Nacional de Humanidades, Ciencias y Tecnolog\u00edas (Conahcyt). 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